灰岩坑古墓的入口位于水下，玩家需要从特定位置潜水进入。首先到达灰岩坑区域的水边，找到有明显气泡或水流涌动的区域，这表明水下存在可进入的通道。潜水后沿着岩壁向前游动，注意避开食人鱼的攻击，通过一段狭窄的水道后即可浮出水面到达内部。上岸后会在右侧发现灰岩坑景点大本营，此处可以保存进度并补充物资。灰岩坑内部结构复杂，分为多个层级，后续探索需要利用攀爬和滑索等移动方式
进入灰岩坑后首要任务是完成基础探索。从大本营出发向右前方移动，在拱形遗迹内可以找到探险家背包，它能在地图上标记本区域的求生贮藏点位置。遗迹外悬挂着用树枝和动物尸骨捆绑的雕像，使用绳索箭矢射击其绳索部位可将其拉下，这是以示尊重挑战的第一项。水下悬崖边缘分布着多个宝箱，需要用登山斧撬开，这些宝箱属于水下宝箱挑战的组成部分。灰岩坑内资源丰富，包括硬木、药草和矿石等，建议在初期探索时尽量收集
圣科尔多瓦古墓是灰岩坑区域的核心挑战。穿过狭窄岩缝后右侧存在堆积尸骨的水道，进入后开始古墓挑战。水道内有两条鳗鱼，需沿左侧草丛前进，暗流会将角色卷入水潭。通过洞穴来到遗迹入口，跳下后右侧是坍塌神庙大本营。石室右侧角落有求生贮藏点，前方通道需推动炮台撞开入口。挑战关键是将卡住的木栏打开，需要操作船上的转杆和桅杆锁扣。旋转转杆移动横杆使炮台砸开木栏，随后用绳索箭矢搭起滑索进入下方甲板
部分区域需利用滑索移动，在灰岩坑景点大本营旁就有滑索点，使用后可快速到达对面平台。水轮机关需要先潜水撬开卡住的木条，再用绳索箭矢连接转轮和岸上转盘，通过旋转使缺口朝下才能从水下通过。巨蛇之眼区域需操作多个龙头转轴引导水流，先凿开挡板再用绳索连接转盘调整龙头方向，使水流驱动水车打开大门。这些机关往往需要配合潜水、绳索和攀爬等多种移动方式才能完全破解
灰岩坑会出现多波敌人攻击，建议提前补充弹药和制作药物。特定区域存在陷阱装置，需要及时割断触发绳索。当完成主要机关操作后，逃离阶段需快速通过唯一通道，在跳板边缘直接跃入洞口即可脱离。灰岩坑内收集品分布广泛，包括文物、探险家背包和求生贮藏点等，全收集需要反复检查各角落。完成主要挑战后，祭坛石碑会奖励凯门蜥之息II能力，显著提升水下呼吸时间
