飞船升级是提升战斗力和探索效率的核心途径。飞船升级主要通过装备、科技和学习三个方向实现。装备升级需要消耗神秘矿石，可通过挖矿或交易获取；科技升级依赖科研点数，通过任务、副本或活动获得；学习新技能则需经验点，通过日常探索和战斗积累。每次升级会消耗飞船能量，需及时补充燃料矿石以维持升级进度。平衡发展装备、科技和技能是提升飞船综合性能的关键。
飞船的动力系统应优先升级曲速引擎至LV.3，可缩短跃迁冷却时间至15秒，随后强化推进器至LV.5提升航速30%。武器系统建议采用单类型专精策略，初期聚焦粒子炮，中期转电磁脉冲炮以获取EMP干扰效果。防御模块需注重护盾回充器与电容扩容的配合，确保每秒护盾恢复量不低于45单位，否则在高强度交火中难以维持战线。改装技术如量子计算机可提升20%锁定速度，跃迁扰断器则能强制目标进入30秒跃迁冷却。
武器掌控属性提升所有武器伤害并解锁高级武器技能；防御操作增加护盾上限和解锁防御技能；电子工程提高能量上限和工程技能；飞船驾驶则增强速度上限和航行技能。属性洗点需消耗神经突触重调器，重置后返还所有属性点。技能升级需达到相应指挥官等级和属性点数，消耗信用点可提升特定武器伤害、护盾抗性或飞船机动性等专项能力。
资源分配需遵循50%量子晶体用于武器升级，30%投入动力系统，20%储备紧急维修的原则。避免过早追求T3级战列舰，其每日维护成本过高，信用点储备不足200万时建议以T2级巡洋舰为核心战力。遭遇未知信号时务必使用频谱分析仪检测威胁等级，安全等级低于0.5的星系需开启自动规避模式，侦测到敌对舰船进入20km范围立即执行45度角变轨机动配合紧急跃迁协议脱离。
