模块装配是提升舰船性能的核心机制，通过合理搭配不同功能的模块，可以显著增强舰船的作战能力或资源采集效率。每艘舰船拥有5-7个配件插槽，玩家需根据舰船类型和战术需求选择对应的模块进行安装。模块主要分为武器系统、防御系统、动力系统和特殊功能系统四大类，其中武器系统直接影响舰船的输出方式，例如导弹、鱼雷、脉冲炮等模块会决定舰船的攻击属性和目标优先级。
模块获取主要通过蓝图研究系统，即开箱或抽卡机制。研究过程中会随机解锁不同舰船型号的模块技术，部分高级模块需要重复研究同一蓝图才能完全激活。技术值是强化模块的关键资源，可通过战斗、任务或重复研究获取。模块强化遵循前排优先护甲，后排优先输出的基本原则，但具体加点需结合舰船定位调整，例如支援型舰船需优先提升雷达锁定速度和冷却缩减属性。
工程类舰船的模块装配逻辑与战斗舰船不同，重点在于提升资源采集速度和仓储容量。采矿平台模块能提供10%-30%的采集效率加成，但仅对所属同盟成员生效，这是引发矿区争夺战的主要原因。资源对接模块可将前哨站与矿点连接，实现被动资源产出，但会禁止盟友采集该矿点。维修模块能提升舰队10%的基础维修速度，适合频繁作战的玩家配置。
战斗舰船的模块搭配需要考虑阵型位置和克制关系。前排舰船应装配护甲、闪避等防御模块，中排舰船适合安装均衡型武器模块，后排舰船则优先选择高伤害但脆弱的远程武器模块。针对敌方舰载机需配备防空模块，对抗战列舰则需要穿甲类武器模块。增援功能可突破指挥值限制临时加入5艘舰船，但会导致舰队丧失曲速航行能力。
高速侦查舰可先抵达目标位置，再通过增援机制快速调动工程船；采矿平台能节省计划圈数量；维修模块仅在基地船坞生效，战斗中无法使用预制模块维修。玩家应定期检查自动撤回功能的设置状态，避免因误操作导致战略失误。技术储备的合理分配比盲目追求高级模块更重要，部分低级模块在特定战术中反而能发挥关键作用。
模块系统的深度定制是游戏策略性的重要体现，需要结合资源储备、舰队规模和同盟战术动态调整。初期应集中资源强化主力舰的核心模块，中后期再逐步完善各舰船的模块协同。采矿与战斗模块的平衡发展能保障资源供给与军事实力同步提升，避免因偏科导致发展受阻。模块装配没有绝对的最优解，需要根据战局变化持续优化配置方案。
