明日之后第二季的核心剧情围绕莱文市的灾变展开，玩家需以战斗等级25级为门槛进入新地图，面对高阶感染者和新增的冷兵器、护甲系统。主策划小晨在访谈中透露，第二季将补充阿列克谢、拉扎罗夫等角色的背景故事，并优化武器耐久机制，削减射击损耗与过热频率。剧情任务中，玩家将遭遇能使用技能的感染者，甚至可短暂变身为感染者体验特殊技能树，通过收集病毒升级能力。
剧情推进的关键节点包括探索水下工厂、护送拉扎罗夫的生物信号等任务。水下工厂任务需注意隐蔽行动与资源管理，建议携带抗感染料理如爱心便当提升容错率。莱文市医院场景设计以恐怖探索为主，部分BOSS需利用环境道具（如镜子）触发弱点机制。中央车站任务线则引入小女孩角色，通过解密和协作揭开城市沦陷的真相。任务过程中，玩家需平衡战斗与剧情选择，不同对话选项可能影响后续NPC互动与奖励获取。
半感染者剧情是第二季的深度内容，玩家需在实验室苏醒后逐步掌握病毒触手攻击与能量吸收机制。该线任务强调道德抉择，例如是否接纳变异力量或坚守人类阵营。与普通感染者不同，半感染者拥有专属技能如隐身、喷毒，但会触发队友敌对状态。任务归去来兮将引导玩家从秋日森林失窃事件调查至莱文市，最终奖励包含配方残页与春节元宝等稀有物资。
幽灵传说等限时剧情任务采用多线索推理模式。玩家需收集丘脑信息、分析目击者证词，最终揭露玛蒂尔达利用变异犬制造的幽灵事件。此类任务通常要求玩家在秋日森林夜间行动，需提前准备抗寒装备与照明工具。辐射高校作为季度性副本，其73层需利用狙击枪控制电路线圈，低庄玩家可通过卡位技巧无伤通关。任务完成后，系统将根据贡献度发放护甲涂装与结构强化材料。
